بخش پاتولوژی و سیتولوژی به بررسی میکروسکوپی بافت‌ها و سلول‌های بدن به منظور تشخیص دقیق بیماری‌ها، به‌ویژه تومورها، ضایعات پیش‌سرطانی، بیماری‌های التهابی و عفونی می‌پردازد. در این بخش، نمونه‌های بافتی و سلولی پس از آماده‌سازی و رنگ‌آمیزی، توسط متخصص آسیب‌شناسی مورد ارزیابی قرار می‌گیرند.

آزمایش‌هایی مانند بررسی نمونه‌های بیوپسی، نمونه‌های جراحی، پاپ‌اسمیر، مایعات بدن و سایر نمونه‌های سیتولوژی در این بخش انجام می‌شود. نتایج حاصل، نقش اساسی در تشخیص قطعی بیماری، تعیین نوع و شدت ضایعات، انتخاب روش درمان و پیگیری روند بیماری ایفا می‌کنند.